Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-7-P1 | cli-mir-7a-2 | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0038396 | MIMAT0038398 | scaffold150 | 999185 | 999248 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-7-P2 | cli-mir-7a-1 | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0038396 | MIMAT0038397 | scaffold432 | 147017 | 147080 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-7-P3 | cli-mir-7b | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0038400 | None | scaffold1374 | 107550 | 107615 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-7-P4 | cli-mir-7a-3 | MIR-7 | GGAAGAC | MIMAT0038396 | MIMAT0038399 | scaffold133 | 436075 | 436137 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all