Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-29-P1b V | cli-mir-29b-1 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0038449 | MIMAT0038450 | scaffold137 | 49405 | 49468 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-29-P1d V | cli-mir-29b-2 | MIR-29 | AGCACCA | None | MIMAT0038450 | scaffold454 | 2208566 | 2208629 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-29-P2b | cli-mir-29a-1 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0038447 | MIMAT0038448 | scaffold137 | 48230 | 48289 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-29-P2d | cli-mir-29a-2 | MIR-29 | AGCACCA | None | MIMAT0038448 | scaffold454 | 2207703 | 2207762 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all