Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-430-P1 | cli-mir-302b-1 | MIR-430 | AAGUGCU | None | MIMAT0038616 | scaffold942 | 1626026 | 1626086 | + | Gnathostomata | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-430-P2 | cli-mir-302c | MIR-430 | AAGUGCU | None | MIMAT0038617 | scaffold942 | 1626310 | 1626366 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-430-P3 | cli-mir-302a | MIR-430 | AAGUGCU | None | MIMAT0038615 | scaffold942 | 1626451 | 1626510 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-430-P4 | cli-mir-302b-2 | MIR-430 | AAGUGCU | None | MIMAT0038616 | scaffold942 | 1626806 | 1626867 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all