Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ab | Ab | He | He | Mi | Mi | Ov | Ov | Ov | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aga-Mir-10-P1 V | aga-mir-10 | MIR-10 | CCCUGUA | MIMAT0001497 | None | NC_064601.1 | 57801554 | 57801615 | - | Bilateria | Eumetazoa | 2 | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aga-Mir-10-P2 | aga-mir-100 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0001498 | None | NC_064602.1 | 10200512 | 10200575 | - | Bilateria | Eumetazoa | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aga-Mir-10-P3 | aga-mir-125 | MIR-10 | CCCUGAG | MIMAT0001500 | None | NC_064602.1 | 10196013 | 10196074 | - | Bilateria | Eumetazoa | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aga-Mir-10-P4 | aga-mir-993 | MIR-10 | ACCCUGU | None | MIMAT0010103 | NC_064601.1 | 57600661 | 57600751 | + | Protostomia | Eumetazoa | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all