MirGeneDB ID | Pca-Mir-87-o22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-87 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Penis worm (Priapulus caudatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Pca-Mir-87-o23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Gsp-Mir-87 Sne-Mir-87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | P. caudatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Priapulus_caudatus_gca000485595v2) |
KQ715638.1: 116649-116711 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGAGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUCGACUCCCUGCGUUUCGUUUCGCCGAUCAGCCUGAGACUUUGGCUCGACCUUUGCUUGCAUAAACUAGGUGAGCAAAGUUUCAGGUGUGUCGGCGCUGCGAGUGAGCUACGAUGAUGAACGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUCGACUCCCUGCGUU--| UU CA G G UUGCUUG UCGU CGCCGAU GCCUGAGACUUUG CUC ACCU \ AGCG GCGGCUG UGGACUUUGAAAC GAG UGGA C CAAGUAGUAGCAUCGAGUG^ UC UG - - UCAAAUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Pca-Mir-87-o22_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAGCCUGAGACUUUGGCUCGACCU -24
Get sequence
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Mature sequence | Pca-Mir-87-o22_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- GUGAGCAAAGUUUCAGGUGUGU -63
Get sequence
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