| MirGeneDB ID | Pab-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-491 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-491 Cfa-Mir-491 Cja-Mir-491 Cpo-Mir-491 Dno-Mir-491 Eca-Mir-491 Hsa-Mir-491 Mml-Mir-491 Mmr-Mir-491 Mmu-Mir-491 Ocu-Mir-491 Rno-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054692.2: 37449361-37449416 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGGGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUCUGCUGUGGGAAUUGACUUAGCUGGGUAGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGAGUAGAACACUCCUUAUGCAAGAUUCCCUUCUACCUGGCUGGGUUGGAGUCAUAUCCUACAGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGUCUGCUGUGGGAAUU--| UG U CC C GUAG GACUUAGC GGUAG GGGGAA CUU CAUGAGGA \ UUGGGUCG CCAUC UCCCUU GAA GUAUUCCU A UGGACAUCCUAUACUGAGG^ GU U A- C CACA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pab-Mir-491_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGA -23
Get sequence
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| Star sequence | Pab-Mir-491_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- CUUAUGCAAGAUUCCCUUCUAC -56
Get sequence
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