MirGeneDB ID | Pab-Mir-4766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-4766 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-4766 Mml-Mir-4766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM068844.1: 47282842-47282897 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUGAAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGUUGACCCUUCUACCUUUCUGAAACUCCUUCUGAAAGAGCAGUUGGUGUUUGUUUUUUACUAAAUAGCAAUUGCUCUUUUGGAAGGAACUUGAGAACACAUUACUCAUUUUAGGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGUUGACCCUUCUACCU--| G AC UG G GUUU UUCU AA UCCUUC AAAGAGCAGUUG UGUUU U AAGA UU AGGAAG UUUCUCGUUAAC AUAAA U GGGAUUUUACUCAUUACAC^ G CA GU G UCAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pab-Mir-4766_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUGAAAGAGCAGUUGGUGUUU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Pab-Mir-4766_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- AUAGCAAUUGCUCUUUUGGAAG -56
Get sequence
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