MirGeneDB ID | Pab-Mir-3174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3174 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-3174 Mml-Mir-3174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054695.2: 93090431-93090500 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUGAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUCCAUGGACCAGCAUCAGCGUUACCUGGUAGUGAGUUAGAGAUGCAGAGCCCUGGGCUCCUCAGCAAACCUACUGGAUCUGCAUUUUAAUUCACAUGCAUGGUAAUGUCUGUAAAGCACUGAUGGACUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GGUCCAUGGACCAGCAUCA- UG -| A G CUGGGCUCCUC GCGUUACC GUA GUGAGUU GAGAUGCAGA CC \ UGUAAUGG CGU CACUUAA UUUUACGUCU GG A UCAGGUAGUCACGAAAUGUC UA A^ - A UCAUCCAAACG . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pab-Mir-3174_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAGUGAGUUAGAGAUGCAGAGCC -23
Get sequence
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Star sequence | Pab-Mir-3174_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
48- AUCUGCAUUUUAAUUCACAUGC -70
Get sequence
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