| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-12095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12095 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-12095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. cuniculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. cuniculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr14: 161843810-161843867 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCCAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAGGCUCCAUGGAAUUAAAUGUUACAGAAGGGCCAAGAACAAUAGAAACUGCAUUGCUUAGUUCCAAUUCCAUUGUUCUUGGCCAUUCUGUAACAUUGCCUAAUAUCUUGCUUUAUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCAGGCUCCAUGGAAUUA--| G A ACUGCAUUG AAUGUUACAGAA GGCCAAGAACAAU GAA C UUACAAUGUCUU CCGGUUCUUGUUA CUU U GUAUUUCGUUCUAUAAUCCG^ A C AACCUUGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ocu-Mir-12095_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGCCAAGAACAAUAGAAACU -21
Get sequence
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| Star sequence | Ocu-Mir-12095_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AUUCCAUUGUUCUUGGCCAUU -58
Get sequence
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