| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-12094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12094 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-12094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. cuniculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. cuniculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chr4: 80950553-80950610 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GACUGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUGAAAGGGAUGAGGUGAGCUCCAGUUCCAGAGCGGAGGUAACAGUACCUCUAGAAAUGAUCCAGAUGACUGUUAGCUCCGAUCAGCACUGAGGCUCCUCUACACUCUACUCCUCUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAUGAAAGGGAUGAGGU---| UC UCCA G G ACC UAGAAA GAGC CAGU GA CGGAG UAACAGU UC \ CUCG GUCA CU GCCUC AUUGUCA AG U AUCUCCUCAUCUCACAUCUC^ GA CGA- A G GU- ACCUAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ocu-Mir-12094_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGAGCGGAGGUAACAGUACCUC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ocu-Mir-12094_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UGACUGUUAGCUCCGAUCAGC -58
Get sequence
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