| MirGeneDB ID | Ocu-Mir-12090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12090 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rabbit (Oryctolagus cuniculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ocu-mir-12090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. cuniculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. cuniculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (oryCun2_add) |
chrUn0504: 10221-10281 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCACGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGAAGCCCGGGGAGCUGCCGCCUGUGCCGGUGUCAGGCUCGGCAGGGACACGCUUCCUACUGAGAUGGCGUCUCACGGCGAGCCUGAUGCCGGCCUGGGCUGGGGGCCUGGCGACUCCUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGAAGCCCGGGGAGCUG- -| U G AGG C CUUCCUA CC GCCUG GCCGGUGUCAGGCUCG C GA ACG C GG CGGGU CGGCCGUAGUCCGAGC G CU UGC U UCUCCUCAGCGGUCCGGG U^ C - GCA C GGUAGAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ocu-Mir-12090_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0048619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUCAGGCUCGGCAGGGACACG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ocu-Mir-12090_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0048620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UCUCACGGCGAGCCUGAUGCC -61
Get sequence
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