MirGeneDB ID | Obi-Mir-12577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12577 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ovu-Mir-12577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ417620: 1197817-1197885 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGUCCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUCUACAGCCGUUACCGAAUCGCAGAGGAAAGUUGGAUUUGUGGAGGCACAUUUUCAGUCUCACCAAACAACAGUUAUGUGUCCCACGGUUCCAACUCUCAGUUGUCGAUAUUAACUUAAAGCAUCAGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AUCUACAGCCGUUACCGA- -| AG A U A UUUCAGUCUCA AUCG CAG GA AGUUGGA UUGUGG GGCACAU C UAGC GUU CU UCAACCU GGCACC CUGUGUA C UGACUACGAAAUUCAAUUA U^ GA C U - UUGACAACAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Obi-Mir-12577_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGUUGGAUUUGUGGAGGCACAUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Obi-Mir-12577_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
47- UGUGUCCCACGGUUCCAACUCU -69
Get sequence
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