MirGeneDB ID | Obi-Mir-12572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12572 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ovu-Mir-12572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ418087: 407333-407393 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCUCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAUUGAAGAGAAAGGAGAUCGGAAACACUUCUCAUGUGUACAUUGAGACGUUUUGAACAUCUGAAAACAUCUCAUGUCUACAUAGAGACGUGUUGAGGGUCAAUACUGAACGGAUAUAUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UCAUUGAAGAGAAAGGA-- GGA U -| U U C UUGAAC GAUC AACAC UCUC AUGUG ACAU GAGA GUU \ CUGG UUGUG AGAG UACAU UGUA CUCU CAA A UUAUAUAGGCAAGUCAUAA GAG C A^ C - A AAGUCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Obi-Mir-12572_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCUCAUGUGUACAUUGAGACGUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Obi-Mir-12572_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CAUCUCAUGUCUACAUAGAGACG -61
Get sequence
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