MirGeneDB ID | Obi-Mir-12567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12567 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ovu-Mir-12567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ416617: 304180-304240 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGCAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UACGCUGUACUUGACUGAUGGACUUGCGGAGGCUUCAUUAUUGCUGCUUUGUGUUUGUUGAACGGCCCAAAGCAAGUUUUGAUGGAGUUGCCGCAACCAUUGCCACAGGAAUCCCAUUGAGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UACGCUGUACUUGACUG----| AC AG UU - UGUUUGU AUGG UUGCGG GCUUCAUUA GCU GCUUUG U UACC AACGCC UGAGGUAGU UGA CGAAAC G GAGUUACCCUAAGGACACCGU^ -- GU UU A CCGGCAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Obi-Mir-12567_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGCUUCAUUAUUGCUGCUUUGU -22
Get sequence
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Mature sequence | Obi-Mir-12567_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAAGCAAGUUUUGAUGGAGUUGC -61
Get sequence
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