MirGeneDB ID | Oan-Mir-7435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7435 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | oan-mir-7435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041749.1: 74723731-74723790 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGGAUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGGUGGUUUAUAUAUUCAUCUUGAAGAACUGGGAUUUGUGUAUGUGAUUGCAGUUGAUGUUCAUAGUAAUUACACAUGUAAAUCUCAGUUGUUCCAAGGUGGCAAUAUGACCUUUUCAGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUGGUGGUUUAUAUAUU- -| G UG A AGUUGA CAUCUU GAA AACUGGGAUUUG U UGUGAUUGC U GUGGAA CUU UUGACUCUAAAU A ACAUUAAUG G GACUUUUCCAGUAUAACG C^ G GU C AUACUU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Oan-Mir-7435_5p |
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mirBase accession | MIMAT0029024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGGAUUUGUGUAUGUGAUUGC -22
Get sequence
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Star sequence | Oan-Mir-7435_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0029025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAUUACACAUGUAAAUCUCAGU -60
Get sequence
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