MirGeneDB ID | Oan-Mir-7422 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7422 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | oan-mir-7422b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041749.1: 43019514-43019569 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACCUCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAAGUCAUUAAAGCUUUUCUUGGAAGAGAAGGGGAGUGCUGUUGGAGUGGCUUUGAUUCAGCCACCUCUGAAGCAACUUUCCAUCUUUUCUUUGAUCUUCACUCUGAUAUAAAGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGAAGUCAUUAAAGCUUU-- UU A GG -| G UG - UUUG UC GGAAGAGA GG AG UGCU U GAG UGGC \ AG UCUUUUCU CC UC ACGA A CUC ACCG A CGAAAUAUAGUCUCACUUCU UU A UU A^ - GU C ACUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Oan-Mir-7422_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0029022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGGGAGUGCUGUUGGAGUGGC -22
Get sequence
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Mature sequence | Oan-Mir-7422_3p |
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mirBase accession | MIMAT0029023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- CACCUCUGAAGCAACUUUCCAUC -56
Get sequence
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