MirGeneDB ID | Oan-Mir-7419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7419 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | oan-mir-7419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041729.1: 72876121-72876179 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUUUAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGACUUCACAUUUUUCCUGGUUGUCCAGGCUUCACAGCCCUUCUAAACAAGUCCUUGAAGGAUGCUUGUUUAGAAGAUCUUUGAACCGUGGUUACCAGUUCUGCACCAUUUUUUCUUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AUGACUUCACAUUUUUC---| UGU - C C CC UCCUUG CUGGU CCA GG UUCA AG CUUCUAAACAAG \ GACCA GGU CC AAGU UC GAAGAUUUGUUC A UUUCUUUUUUACCACGUCUU^ UU- G - U UA GUAGGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Oan-Mir-7419_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0028986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUUCACAGCCCUUCUAAACAAG -22
Get sequence
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Mature sequence | Oan-Mir-7419_3p |
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mirBase accession | MIMAT0028987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UGUUUAGAAGAUCUUUGAACCG -59
Get sequence
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