| MirGeneDB ID | Oan-Mir-1391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1391 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | oan-mir-1391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041749.1: 102679447-102679506 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GCCAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCAGAAGGUUUGACACGGGGUCUCCUGCUGCGCCAGUAUCGGGUGGGUGAUGGAUGAACUUUAGGCAGUCUCCCACCCGGUAGUGGUGCUGCAAGAUUCCCAAUCUCAAAGAGGACACAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCAGAAGGUUUGACACG--| UC C U G U GGAUGAA GGG UC UGC GCGCCA UAUCGGGUGGG GAU C CCC AG ACG CGUGGU AUGGCCCACCC CUG U AACACAGGAGAAACUCUAA^ UU A U G U ACGGAUU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Oan-Mir-1391_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0007185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGCCAGUAUCGGGUGGGUGAU -21
Get sequence
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| Star sequence | Oan-Mir-1391_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0007186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UCUCCCACCCGGUAGUGGUGCU -60
Get sequence
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