MirGeneDB ID | Oan-Mir-1389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1389 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | oan-mir-1389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041743.1: 12605067-12605125 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CUGGGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCAGCGGAAUUGGCCGAUCCCGGCUUGUUCCUCGGCGUUUCCGGCACGGCCAAGUGAUGCGUUUCUGACUGGGCUGGAAAAUCGAGUGAACUGGCCAGGGAGCUCCAGGUCAGCCGGGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GCAGCGGAAUUGGCCGA- - U -| CG A C AGUGAU UCCC GGCU GUUC CUCGG UUUCCGGC CGG CA \ AGGG CCGG CAAG GAGCU AAAGGUCG GUC GU G GGGGCCGACUGGACCUCG A U U^ A- G A CUUUGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Oan-Mir-1389_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0026758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCGGCGUUUCCGGCACGGCCA -22
Get sequence
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Mature sequence | Oan-Mir-1389_3p |
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mirBase accession | MIMAT0007174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- ACUGGGCUGGAAAAUCGAGUGA -59
Get sequence
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