| MirGeneDB ID | Oan-Mir-1380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1380 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | oan-mir-1380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041731.1: 68255444-68255502 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUUAGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGCUUUGAUGCAGUGAUCACCACCUUGUCACAUCCCUUCUGUCUGCACCUGUGGGGAAAAUCUUAAGGUUUAGUCAGGUGGGGUGUGACAAGGAAGUCGAAAGAAUCAUUUUCAAAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGCUUUGAUGCAGUGA- -| CA U U C GUGGGGA UC AC CCUUGUCACAUCCC UCUG CUG ACCU \ AG UG GGAACAGUGUGGGG GGAC GAU UGGA A CAAAACUUUUACUAAGAA C^ AA U U U AUUCUAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Oan-Mir-1380_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0007116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACAUCCCUUCUGUCUGCACCU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Oan-Mir-1380_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0007117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- GUUUAGUCAGGUGGGGUGUGA -59
Get sequence
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