| MirGeneDB ID | Oan-Mir-1332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1332 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | oan-mir-1332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041729.1: 51196742-51196796 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUGGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GACAGACGAGAAGCCAUUCCCGACCAAUCAGAGGCCAUCUUCAACCGAUCGGGAACAGUCUCCAAUUGGUUAGAGGUGGUCUCUGACUGGCCAAGGGUACCGUGCAACCUUCGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GACAGACGAGAAGCCAUU GA--| A UC C GAAC CCC CCA UCAGAGGCCAUCU AACCGAU GG \ GGG GGU AGUCUCUGGUGGA UUGGUUA CC A AGGCUUCCAACGUGCCAU AACC^ C GA A UCUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Oan-Mir-1332_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGGCCAUCUUCAACCGAUCGG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Oan-Mir-1332_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- AAUUGGUUAGAGGUGGUCUCUG -55
Get sequence
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