MirGeneDB ID | Nve-Mir-2045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2045 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Starlet sea anemone (Nematostella vectensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | nve-mir-2045 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | N. vectensis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | N. vectensis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000209225.1_ASM20922v1_NVE) |
NW_001834371.1: 186020-186081 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCCAGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAUUUAUGUCUUAUUAAUGACAAUAGUUUUCCCAGAGUGUUGAGUUCAUACAAGAUUUCUUGUGCUUGUAUGGUAAUUAAUCUCUGGUACAUAGAUUCCAUAAAAUACAUUGACUGAAAUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AAAUUUAUGUCUUAUUAAUGACAAUAGUUUUC--| U GU- GAUUU CCAGAG GUUGA UCAUACAA C GGUCUC UAAUU GGUAUGUU U UUAAAGUCAGUUACAUAAAAUACCUUAGAUACAU^ - AAU CGUGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Nve-Mir-2045_5p |
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mirBase accession | MIMAT0009814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCCCAGAGUGUUGAGUUCAUACAA -24
Get sequence
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Star sequence | Nve-Mir-2045_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0009815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- GUAUGGUAAUUAAUCUCUGGUACA -62
Get sequence
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