MirGeneDB ID | Mun-Mir-12609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12609 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Microcaecilia (Microcaecilia unicolor) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Xla-Mir-12609-P1 Xla-Mir-12609-P2 Xtr-Mir-12609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Amphibia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Amphibia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_901765095.2_aMicUni1.2) |
LR594633.1: 411974653-411974710 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCGCGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAUCUUGCAUCGUUUACUGCUUCACGUUGCAUCGCGUUAACCGGAAGUCUCAUGUUUCACUAUGAGACUUCUGGAUGACACGACGUGAUGUGAUGUGGAAUGCCUCGAGAUACCAUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAAUCUUGCAUCGUUUA--|UG U UG A C A AUGUU C C UCACGU C UCG GUUA CCGGAAGUCUC U G G AGUGUA G AGC CAGU GGUCUUCAGAG C GUACCAUAGAGCUCCGUAA^GU U GU C A A UAUCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mun-Mir-12609_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAUCGCGUUAACCGGAAGUCUC -22
Get sequence
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Star sequence | Mun-Mir-12609_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- GACUUCUGGAUGACACGACGUG -58
Get sequence
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