| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3099 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Rno-Mir-3099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 6803600-6803659 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGCUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCAAGCCUGCUGAACGAUCGAUCCCCAUCCCAGCUUCCUUCCAGCCCUUGAUGUUUUAGUACGCACAUAGGCUAGAGAGAGGUUGGGGAUGGGGAAAGAUGAGAGCAUCGAAUGCAGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUCAAGCCUGCUGAACG-- GA -| C C CU AUGUUUU AUC UCCCCAU CCCAGCUUC UUC AGCC UG \ UAG AGGGGUA GGGUUGGAG GAG UCGG AC A AGGACGUAAGCUACGAGAG AA G^ A A AU ACGCAUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-3099_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAGCUUCCUUCCAGCCCUUG -21
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0014815 TargetScanVert: mmu-miR-3099-5p miRDB: MIMAT0014815 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3099_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014816 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UAGGCUAGAGAGAGGUUGGGGA -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0014816 TargetScanVert: mmu-miR-3099-3p miRDB: MIMAT0014816 |
