| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1955 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Rno-Mir-1955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 92191994-92192056 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUCCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGCUGUGAAAAGCUGGUUUACUUACUACAAGUCCCAGGAUGCACUGCAGCUUUUUCUUAACUUCAGAUAAGAGCAUUGCAUGCUGGGACAUGUAGUUGGUUUAAAUAGCACGGAGAACUCUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUGCUGUGAAAAGCUGGUUU--| U A G C AG UUUCUUA ACU ACUACA GUCCCAG AUGCA UGC CUU A UGG UGAUGU CAGGGUC UACGU ACG GAA C UUCUCAAGAGGCACGAUAAAUU^ U A G U A- UAGACUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1955_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUCCCAGGAUGCACUGCAGCUU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009426 TargetScanVert: mmu-miR-1955-5p miRDB: MIMAT0009426 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1955_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- GAGCAUUGCAUGCUGGGACAUG -63
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1955-3p miRDB: MIMAT0017348 |
