MirGeneDB ID | Mml-Mir-12463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12463 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-12463 Pab-Mir-12463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014340.1: 57748177-57748235 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGCAGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGCACGCAGUUAGAAGAAAGCAUCACUCAACAUAAACUGCAUGCCUGCACACCAGGCGUGCAGUGAUGUGCAGAUGUGCAGUUUAUGUUCAUAAACUGCAUGCCUGCACACCAGGCGUGCAGUGAUGUGCAGAUGUGCAGUUUAUGUUAAGUGAUGCUUUCUUGGUUCCUAUACUGCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGCACGCAGUUAGAAGA--| CAACAUAAACUGCAUGCCUGCACACCAGGCG AAGCAUCACU \ UUCGUAGUGA U UCGUCAUAUCCUUGGUUCU^ AUUGUAUUUGACGUGUAGACGUGUAGUGACG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-12463_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UGUGCAGAUGUGCAGUUUAUGUU -59
Get sequence
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Co-mature sequence | Mml-Mir-12463_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAUAAACUGCAUGCCUGCACACC -23
Get sequence
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