MirGeneDB ID | Mdo-Mir-12325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12325 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mdo-mir-12325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. domestica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | M. domestica | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (monDom5_add) |
2: 266544099-266544153 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGCAUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUUAUUUUGACACACUGCCUUGUACGUAGUGGGUACUUAUUCAAUGUUUGUUAGUUAGUCAAUAAGCAUUAUUAAGUAUCUACUGUGUGCCAGGUCAAAUUGCCACCAUUCAUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAUUAUUUUGACACACU--| U UUC AGU GCCU GUACGUAGUGGGUACUUA AAUGUUUGUU U UGGA CGUGUGUCAUCUAUGAAU UUACGAAUAA A UUACUUACCACCGUUAAAC^ C UA- CUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mdo-Mir-12325_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0050172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGGUACUUAUUCAAUGUUUGUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Mdo-Mir-12325_3p |
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mirBase accession | MIMAT0050173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
33- UAAGCAUUAUUAAGUAUCUACU -55
Get sequence
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