MirGeneDB ID | Hsa-Mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-151 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-151a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-151 Cfa-Mir-151 Cja-Mir-151 Cpo-Mir-151 Dno-Mir-151 Eca-Mir-151 Ete-Mir-151 Laf-Mir-151 Mml-Mir-151 Mmr-Mir-151 Mmu-Mir-151 Ocu-Mir-151 Pab-Mir-151 Rno-Mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr8: 140732587-140732643 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGAGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCAAAGAUGACUAAAACACUUUUCCUGCCCUCGAGGAGCUCACAGUCUAGUAUGUCUCAUCCCCUACUAGACUGAAGCUCCUUGAGGACAGGGAUGGUCAUACUCACCUCGGUGUUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GCAAAGAUGACUAAAAC--| U C CA UGUCU ACU UUCCUG CCUCGAGGAGCU CAGUCUAGUA C UGG AGGGAC GGAGUUCCUCGA GUCAGAUCAU A GUUGUGGCUCCACUCAUAC^ U A A- CCCCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | The highest expression of the 3p arm has a 1 nt addition of an "A." However when seen the 3' offset reads suggests that this is the correct Drosha cut. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-151_5p |
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mirBase accession | MIMAT0004697 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCGAGGAGCUCACAGUCUAGUA -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004697 TargetScanVert: hsa-miR-151a-5p TargetMiner: hsa-miR-151a-5p miRDB: MIMAT0004697 |
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Co-mature sequence | Hsa-Mir-151_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CUAGACUGAAGCUCCUUGAGG -57
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000757 TargetScanVert: hsa-miR-151a-3p TargetMiner: hsa-miR-151a-3p miRDB: MIMAT0000757 |