| MirGeneDB ID | Dme-Mir-986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-986 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCGAAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-986 Dsi-Mir-986 Dya-Mir-986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster group | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster group | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 8445000-8445067 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCACGCAGAGGACACACCUGAAAUUACCCAUCUCGAAUAGCGUUGUGACUGAGGUAACUGCGCAUCGAAUCUACUCAGCGGCGAGGCUAUUCAAGUAAGGUUAUUUUGGGCCAGCGACUUUACGACCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CCACGCAGAGGACACAC--|UG U CAU C G GA GGUAACUGCG C AAAU ACC CU GAAUAGC UUGU CUGA C G UUUA UGG GA CUUAUCG AGCG GACU A GCCAGCAUUUCAGCGACCG^GU U AAU A G GC CAUCUAAGCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dme-Mir-986_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0005503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUCGAAUAGCGUUGUGACUGA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005503 TargetScanFly: dme-miR-986 |
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| Star sequence | Dme-Mir-986_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
46- AGCGGCGAGGCUAUUCAAGUAA -68
Get sequence
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