| MirGeneDB ID | Dme-Mir-1007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1007 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-1007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-1007 Dsi-Mir-1007 Dya-Mir-1007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster group | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster group | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 21296385-21296449 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGGCGAGGAUGACAACGAAUCUGUACAGUGUAAGCAGUGUUUGAACUCGAUCUUGGUUCUUGGACUCUUGAUAAGCUCAAUUAACUGUUUGCAGCGGACGGGAUCUUCUCGGAGAAUCGACGACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGGCGAGGAUGACAAC-- A ACA - GU-| A CG UUGGUUCU GA UCUGU G UGUAAGCAGU UUGA CU AUC \ CU GGGCA C ACGUUUGUCA AACU GA UAG U CAGCAGCUAAGAGGCUCUU A GG- G AUU^ C A- UUCUCAGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-1007_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAAGCAGUGUUUGAACUCGAUC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-1007_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- UAAGCUCAAUUAACUGUUUGCAG -65
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005020 TargetScanFly: dme-miR-1007 |
