| MirGeneDB ID | Dlo-Mir-3770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3770 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bge-Mir-3770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087225.1: 14931174-14931236 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCCUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGUUCGUGUUAACAAUAGCAUACCGACGUAAUCCUGCAUCAAGUGCGUUGCGAGUGUCAAUAUAAGUUGCAAUGCAUUGCACGCAGGAUAGCGUUUGUGUGCUCAUAGACAACGACUUGGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUGUUCGUGUUAACAAU--| C A AUCA GAGUGUCA AGCAUAC GACGU AUCCUGC AGUGCGUUGC \ UCGUGUG UUGCG UAGGACG UUACGUAACG A GGGGUUCAGCAACAGAUAC^ U A CACG UUGAAUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dlo-Mir-3770_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAUCCUGCAUCAAGUGCGUUGC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dlo-Mir-3770_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AAUGCAUUGCACGCAGGAUAGC -63
Get sequence
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