MirGeneDB ID | Cte-Mir-2703-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2703 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cte-mir-2703-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cte-Mir-2703-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. teleta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | C. teleta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_394: 5014-5072 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GCUUUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCAGCUCAGAGAAGACGGAACCAGUGACUUGAGCUUACGAAUCAUCAGCCAUUGCUCGCUUUGAAAUGCUUUGAUUUGUAAGCUCAGCAGGCGUGGUUUCAAAUGCAACAGAUGACCAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUCAGCUCAGAGAAGAC- -| GAC UC C GCUCG GGAACCA GU UUGAGCUUACGAAUCA AGC AUU \ CUUUGGU CG GACUCGAAUGUUUAGU UCG UAA C ACCAGUAGACAACGUAAA G^ GAC U- - AGUUU 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cte-Mir-2703-P1_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0013567 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGCUUACGAAUCAUCAGCCAUU -24
Get sequence
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Mature sequence | Cte-Mir-2703-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0013568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UGCUUUGAUUUGUAAGCUCAGC -59
Get sequence
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