MirGeneDB ID | Csc-Mir-190-P17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-190 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Arizona bark scorpion (Centruroides sculpturatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Csc-Mir-190-P18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-190 Aga-Mir-190 Agr-Mir-190 Asu-Mir-190 Bfl-Mir-190 Bge-Mir-190 Bko-Mir-190 Bla-Mir-190 Bpl-Mir-190 Cbr-Mir-190 Cel-Mir-190 Cte-Mir-190 Dan-Mir-190 Dlo-Mir-190 Dma-Mir-190 Dme-Mir-190 Dmo-Mir-190 Dpu-Mir-190 Dsi-Mir-190 Dya-Mir-190 Eba-Mir-190 Egr-Mir-190 Esc-Mir-190 Gpa-Mir-190 Gsa-Mir-190 Hme-Mir-190 Hmi-Mir-190 Hru-Mir-190 Isc-Mir-190 Mgi-Mir-190 Mom-Mir-190 Npo-Mir-190 Obi-Mir-190 Ofu-Mir-190 Ovu-Mir-190 Pau-Mir-190 Pca-Mir-190 Pdu-Mir-190 Pfl-Mir-190 Pmi-Mir-190 Pve-Mir-190 Rph-Mir-190 Sko-Mir-190 Sma-Mir-190 Snu-Mir-190 Tca-Mir-190 Tur-Mir-190 War-Mir-190 Xbo-Mir-190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. sculpturatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000671375.1_CSC) |
NW_019384895.1: 258792-258850 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAUAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUUUGCUGGUUUACUGCCUCCUAGCUGUAUGAUAUGUUUGAUAUUCUUGGUUGUGGCCUGACUUCAACCGAGGAUCAGACAUAUGCUUACAGAGAGGGGUGCAGACUGCAACUUUUCAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UAUUUGCUGGUUUACUGC- AG UG-| UA UGGCC CUCCU CUGUA AUAUGUUUGA UUCUUGGUUG \ GGGGA GACAU UAUACAGACU AGGAGCCAAC U ACUUUUCAACGUCAGACGU GA UCG^ -- UUCAG 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Csc-Mir-190-P17_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAUAUGUUUGAUAUUCUUGGUUG -24
Get sequence
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Star sequence | Csc-Mir-190-P17_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- ACCGAGGAUCAGACAUAUGCUU -59
Get sequence
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