| MirGeneDB ID | Cja-Mir-584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-584 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-584 Mml-Mir-584 Pab-Mir-584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021916.1: 45807507-45807568 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCUGGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUGGGAGAGUGACUUAGGGUGACCAGCCAUUCUGGUUUGUGUGGGACUGAGGAAUUUGCUGGGAUAUGUCAGUUCCAGGCCAACCAGGCUGGUUGGUCUCCCUGAAACAACCUUCUUGCUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUGGGAGAGUGACUUA--| U UU U G GGAAUUUG GGG GACCAGCCA CUGGUU GU UGGGACUGA C CCC CUGGUUGGU GACCAA CG ACCUUGACU U UUCGUUCUUCCAACAAAGU^ U CG C G GUAUAGGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cja-Mir-584_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUGGUUUGUGUGGGACUGA -21
Get sequence
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| Star sequence | Cja-Mir-584_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AGUUCCAGGCCAACCAGGCUG -62
Get sequence
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