| MirGeneDB ID | Cja-Mir-1266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1266 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-1266 Mml-Mir-1266 Pab-Mir-1266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021924.1: 35779173-35779229 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUAGGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGCCUUGUUUGAUGCUGGACAGGUAGUGUCCUUAGGGGCUAUAGAACAGGGCUGGGAUUACUGAAGCCUGUUCUAUGCCCUGAGGGACACUGAGCAUGUCAUUCCCCUUCUCCAAGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGCCUUGUUUGAUGCUGG GG--| A U G UGGGAU ACA UAGUGUCCUU GGGGC AUAGAACAGG C \ UGU GUCACAGGGA UCCCG UAUCUUGUCC G U UGAACCUCUUCCCCUUAC ACGA^ G - - AAGUCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cja-Mir-1266_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUAGGGGCUAUAGAACAGGGC -22
Get sequence
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| Star sequence | Cja-Mir-1266_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- GCCUGUUCUAUGCCCUGAGGGA -57
Get sequence
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