| MirGeneDB ID | Cel-Mir-796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-796 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 1798941-1799001 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUAAAUACUUCAGAUACUCUAAUGACAAGCUGGAAUGUAGUUGAGGUUAGUAAAAGCACUAUACUUGUUACAAACCUUGCCACGUUCCGACUUGUCAAAAGAGUCACAAAACUACAGCAGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUAAAUACUUCAGAUAC--| AA C A U A AAGCAC UCU UGACAAG UGGAAUGU GU GAGGUU GUAA U AGA ACUGUUC GCCUUGCA CG UUCCAA CAUU A GGACGACAUCAAAACACUG^ AA A C - A GUUCAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cel-Mir-796_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0004231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAAUGUAGUUGAGGUUAGUAA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004231 TargetScanWorm: cel-miR-796 |
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| Star sequence | Cel-Mir-796_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- ACAAACCUUGCCACGUUCCGAC -61
Get sequence
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