| MirGeneDB ID | Cel-Mir-63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-63 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 17598785-17598849 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUGACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACUUUAUUCAUUCAACAAGCAGACACAAUUUCUAACUCGUCGGUAGUCAUCGUUCUAGCUGAAAAGGACACUAUGACACUGAAGCGAGUUGGAAAUAGUGGUUCUACUUGAGCAAAACUGUUGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACUUUAUUCAUUCAACAAGCAGA-- A --| A C UCUAGCU CAC AUUUCUAACUCGU CGGU GUCAU GU G GUG UAAAGGUUGAGCG GUCA CAGUA CA A AAGUUGUCAAAACGAGUUCAUCUUG A AA^ - U CAGGAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-63_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0015104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUAACUCGUCGGUAGUCAUCGU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015104 |
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| Mature sequence | Cel-Mir-63_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UAUGACACUGAAGCGAGUUGGAAA -65
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000035 TargetScanWorm: cel-miR-63 |
