| MirGeneDB ID | Cel-Mir-59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-59 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrIV: 11309169-11309234 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CGAAUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUGAUAUUUUGAGUUGAUCUAGAUAUGACAUCGUCCUGAAAACGAAACGGAACAAAAGUUCAAGAUAUUGAUUUCGAAUCGUUUAUCAGGAUGAUGUGAUUAAAAUCAACUCGGACGGUAAGCGAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUGAUAUUUUGAGUUGAUCUA ---- G -| AA CAAAAGUUC GAU AU ACAUCGUCCUGA AAACGA CGGAA \ CUA UA UGUAGUAGGACU UUUGCU GCUUU A GAGCGAAUGGCAGGCUCAA-- AAAU G A^ AA AGUUAUAGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-59_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0015101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGUCCUGAAAACGAAACGGAA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0015101 |
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| Mature sequence | Cel-Mir-59_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UCGAAUCGUUUAUCAGGAUGAUG -66
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000031 TargetScanWorm: cel-miR-59 |
