| MirGeneDB ID | Cel-Mir-2953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2953 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAUCACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-2953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrII: 6747182-6747242 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUGAUAACUAGAAGACUUCAAAUUUCCAGAUACAGAAGUGUUCGUGAAAAUAAAUAUGUGUUUUUUUUAUGAUCACUAGCUCUUCUGUAGCUGAAAAAACUUGAAAAUAAUAUUUUAAUCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AUGAUAACUAGAAGACUUCAAAUUUC--| A U C AA AAUAUGU CAG UACAGAAG GUU GUGA AUA \ GUC AUGUCUUC CGA CACU UAU G GCUAAUUUUAUAAUAAAAGUUCAAAAAA^ G U U AG UUUUUUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-2953_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACAGAAGUGUUCGUGAAAAUA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0014446 TargetScanWorm: cel-miR-2953-5p |
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| Mature sequence | Cel-Mir-2953_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UGAUCACUAGCUCUUCUGUAGC -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0014447 TargetScanWorm: cel-miR-2953-3p |
