| MirGeneDB ID | Cel-Mir-2221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2221 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-2221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 1390879-1390939 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUUUAUUCUUACUGUCCUCGAAUACAAACUGGCGGUUUGCAUUCACUUACAUUUAUAAGACAAAAAUGCAAGUGAUACCAGACCGCUAGUUUGUAAAAGGGAUAAUUUUAUGUGAAAUUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAUUUAUUCUUACUGUC--| GAA CAU A UUUAUAA CUC UACAAACUGGCGGUUUG UCACUU CA \ GGG AUGUUUGAUCGCCAGAC AGUGAA GU G CUUAAAGUGUAUUUUAAUA^ AAA CAU C AAAAACA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-2221_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGCGGUUUGCAUUCACUUACA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-2221_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0011463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CAAGUGAUACCAGACCGCUAGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0011463 TargetScanWorm: cel-miR-2221 |
