| MirGeneDB ID | Cel-Mir-1819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1819 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-1819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrX: 16207966-16208026 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUAUAUAUUCAUGCUGAAAAAUCAGUGAUCAAUCAUGCUCAAAACAUUCGACAUAACUUAAUUUCUUUGUGGAAUGAUUGAGCUUGAUGGAUCGAUGAAAGAGUACACAUUUUUCUACAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AUAUAUAUUCAUGCUGAAAAA--| G A U AA G UAACUU UCA UGAUC AUCA GCUCAA CAUUC ACA A AGU GCUAG UAGU CGAGUU GUAAG UGU A AAACAUCUUUUUACACAUGAGAA^ A G U A- G UUCUUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-1819_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAUCAUGCUCAAAACAUUCGACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-1819_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UGGAAUGAUUGAGCUUGAUGGA -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0006586 TargetScanWorm: cel-miR-1819 |
