MirGeneDB ID | Aae-Mir-1890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1890 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-1890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-1890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Culicidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Culicidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.204: 1733314-1733377 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAAAUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGCAGUGAUCAAGGAUAUCGACAUACGGCUAGAGCUAAUUGGAGAGUUCUUGAAUAGUGUUGUGAACCUUCAUGAAAUCUUUGAUUAGGUCUGGUCGUGGUGGUUUAUCAACGCGUUGGAUUCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AGCAGUGAUCAAGGAUAUCGA- -| G UG G U AAUAGUGU CA UACGGCUAGA CUAAU GAGA UUC UG U GU GUGCUGGUCU GAUUA UUCU AAG AC G UCUUAGGUUGCGCAACUAUUUG G^ G GU A U UUCCAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aae-Mir-1890_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAGCUAAUUGGAGAGUUCUUG -22
Get sequence
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Mature sequence | Aae-Mir-1890_3p |
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mirBase accession | MIMAT0014247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- UGAAAUCUUUGAUUAGGUCUGG -64
Get sequence
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