MirGeneDB ID | Aae-Mir-11895-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-11895 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-11895-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aae-Mir-11895-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.216: 1788479-1788538 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GCAGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCAGUGUUUUCCAACUCGGCCUGCAGAUAAGCAGGAGUGAAUGCAUGAGUUUGGCAUUUGAAACUAAUUCAUGCAUUCACUUCUGCUGAUCUUCUGUGCGGAUGAUCUUCAGUUCAUUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUCAGUGUUUUCCAACU- G CU UA---| UGGCAU C GC GCAGA AGCAGGAGUGAAUGCAUGAGUU U G CG UGUCU UCGUCUUCACUUACGUACUUAA U UUUACUUGACUUCUAGUA G -- UCUAG^ UCAAAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aae-Mir-11895-P1_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGCAGGAGUGAAUGCAUGAGUU -22
Get sequence
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Star sequence | Aae-Mir-11895-P1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0045992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UUCAUGCAUUCACUUCUGCUGA -60
Get sequence
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