Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Mu | Mu | Mu | Mu | Mu | Mu | Mu | Mu | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mmr-Mir-15-P1a | mmr-mir-15a | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0049138 | None | CM007673.1 | 64040797 | 64040855 | + | Gnathostomata | Olfactores | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mmr-Mir-15-P1b | None | MIR-15 | AGCAGCA | None | None | CM007661.1 | 53190012 | 53190071 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mmr-Mir-15-P1d | mmr-mir-497 | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0049173 | None | CM007676.1 | 56049701 | 56049762 | + | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mmr-Mir-15-P2a | None | MIR-15 | AGCAGCA | None | None | CM007673.1 | 64040937 | 64041001 | + | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mmr-Mir-15-P2b | None | MIR-15 | AGCAGCA | None | None | CM007661.1 | 53189860 | 53189924 | - | Gnathostomata | Olfactores | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mmr-Mir-15-P2d | mmr-mir-195 | MIR-15 | AGCAGCA | MIMAT0049233 | None | CM007676.1 | 56050021 | 56050081 | + | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all