Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ad | Fe | Fe | Fe | Fe | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hme-Mir-279-o1 | hme-mir-279a | MIR-279 | GACUAGA | None | MIMAT0024961 | HE668381 | 19337 | 19392 | - | H. melpomene | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hme-Mir-279-o2 | hme-mir-279c | MIR-279 | GACUAGA | None | MIMAT0024966 | HE671887 | 111974 | 112030 | + | H. melpomene | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hme-Mir-279-P2 | hme-mir-279b | MIR-279 | GACUAGA | None | MIMAT0024964 | HE670979 | 5122 | 5178 | - | Pancrustacea | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hme-Mir-279-P3 | hme-mir-279d | MIR-279 | GACUAGA | None | MIMAT0024965 | HE670979 | 4652 | 4714 | - | Pancrustacea | Protostomia | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all