| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bl | Bl | Bl | Bl | Oo | Oo | Oo | Oo | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-196-P4 | cpo-mir-196c | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0047080 | MIMAT0047081 | scaffold_9 | 45819379 | 45819437 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-196-P3 | cpo-mir-196a | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0047078 | MIMAT0047079 | scaffold_53 | 8623790 | 8623849 | + | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-196-P1 | cpo-mir-196b | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0047082 | MIMAT0047083 | scaffold_44 | 3907441 | 3907498 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
