| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | An | An | Bl | Ce | Co | He | Hi | Hi | Hy | Ki | Ki | Li | Lu | Ov | Sk | Te | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-130-P1c | cfa-mir-130a | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0006631 | chr18 | 38543618 | 38543679 | - | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-130-P2a | cfa-mir-301b | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0009854 | chr26 | 30924110 | 30924169 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-130-P2b | cfa-mir-301a | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0009853 | chr9 | 33724582 | 33724643 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-130-P3b | cfa-mir-454 | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0009927 | chr9 | 33714194 | 33714258 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-130-P4a | cfa-mir-130b | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0006659 | chr26 | 30924432 | 30924491 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
