MirGeneDB ID | Hsa-Let-7-P2a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | LET-7 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-let-7a-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Let-7-P1b Hsa-Let-7-P1c Hsa-Let-7-P1d Hsa-Let-7-P2a2 Hsa-Let-7-P2a3 Hsa-Let-7-P2b1 Hsa-Let-7-P2b2 Hsa-Let-7-P2b3 Hsa-Let-7-P2c1 Hsa-Let-7-P2c2 Hsa-Let-7-P2c3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Let-7 Aca-Let-7-P2a1 Ami-Let-7-P2a1 Bge-Let-7 Bpl-Let-7 Bta-Let-7-P2a1 Cfa-Let-7-P2a1 Cgi-Let-7 Cli-Let-7-P2a1 Cmi-Let-7-P2a1 Cpi-Let-7-P2a1 Cpo-Let-7-P2a1 Cte-Let-7 Dan-Let-7 Dma-Let-7 Dme-Let-7 Dmo-Let-7 Dno-Let-7-P2a1 Dpu-Let-7 Dre-Let-7-P2a1a Dsi-Let-7 Dya-Let-7 Esc-Let-7 Ete-Let-7-P2a1 Gga-Let-7-P2a1 Gja-Let-7-P2a1 Gmo-Let-7-P2a1a Hme-Let-7 Isc-Let-7 Lan-Let-7 Lch-Let-7-P2a1 Lgi-Let-7 Loc-Let-7-P2a1 Mal-Let-7-P2a1a Mdo-Let-7-P2a1 Mml-Let-7-P2a1 Mmu-Let-7-P2a1 Mun-Let-7-P2a1 Npo-Let-7 Oan-Let-7-P2a1 Obi-Let-7 Ocu-Let-7-P2a1 Ovu-Let-7 Pbv-Let-7-P2a1 Pfl-Let-7 Pmi-Let-7 Rno-Let-7-P2a1 Sha-Let-7-P2a1 Sko-Let-7 Spt-Let-7-P2a1 Spu-Let-7 Sto-Let-7-P2a1 Tca-Let-7 Tgu-Let-7-P2a1 Xbo-Let-7 Xla-Let-7-P2a1c Xla-Let-7-P2a1d Xtr-Let-7-P2a1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr9: 94175962-94176033 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Let-7-P2a1) |
Let-7-P2a1
chr9: 94175962-94176033 [+]
UCSC
Ensembl
Let-7-P2b1 chr9: 94176353-94176429 [+] UCSC Ensembl Let-7-P2c1 chr9: 94178841-94178915 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCACCCUGGAUGUUCUCUUCACUGUGGGAUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUUUAGGGUCACACCCACCACUGGGAGAUAACUAUACAAUCUACUGUCUUUCCUAACGUGAUAGAAAAGUCUGCAUCCAGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UUCACCCUGGAUGUUCU- -| UG U GU UUAGGGUCACACC CU UCAC UGGGA GAG AGUAGGUUGUAUAGUU \ GA AGUG AUCCU UUC UCAUCUAACAUAUCAA C CGGACCUACGUCUGAAAA U^ CA - UG UAGAGGGUCACCA 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hsa-Let-7-P2a1_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0000062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000062 TargetScanVert: hsa-let-7a-5p TargetMiner: hsa-let-7a-5p miRDB: MIMAT0000062 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hsa-Let-7-P2a1_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0004481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
51- CUAUACAAUCUACUGUCUUUC -72
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004481 TargetScanVert: hsa-let-7a-3p TargetMiner: hsa-let-7a-3p miRDB: MIMAT0004481 |