| MirGeneDB ID | Ami-Mir-137-P3-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | American alligator (Alligator mississippiensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ami-mir-137b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ami-Mir-137-P1-v1 Ami-Mir-137-P1-v2 Ami-Mir-137-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aca-Mir-137-P3-v2 Asu-Mir-137 Bfl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cgi-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cpi-Mir-137-P3-v2 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gga-Mir-137-P3-v1 Gga-Mir-137-P3-v2 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3a-v1 Gmo-Mir-137-P3a-v2 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v2 Hme-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Loc-Mir-137-P3-v1 Loc-Mir-137-P3-v2 Mal-Mir-137-P3a-v1 Mal-Mir-137-P3a-v2 Mal-Mir-137-P3b-v1 Mal-Mir-137-P3b-v2 Mdo-Mir-137-P3-v1 Mdo-Mir-137-P3-v2 Mun-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Oan-Mir-137-P3-v2 Obi-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pbv-Mir-137-P3-v2 Pma-Mir-137-o3 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Spu-Mir-137 Tni-Mir-137-P3b Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000281125.3_ASM28112v4_AMI_add) |
NW_017708461.1: 34909-34967 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-137-P3-v1) |
Mir-137-P3-v2
NW_017708461.1: 34908-34968 [-]
UCSC
Mir-137-P3-v1 NW_017708461.1: 34909-34967 [-] UCSC |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGGCUCGCGGAGCCCAGCUCCCUUCGAUGACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUACGGCUGGCGUUGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGUCGAGGGGAGAGACACUCGCCUCCCACCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAGGCUCGCGGAGCCCAG--| G G UG A CGGC CUCCCUUCGAU ACG GUAUUCU GGUAG UAAUA U GAGGGGAGCUG UGC CAUAAGA UCGUU AUUGU G GCCCACCCUCCGCUCACAGA^ A G GU - UGCG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ami-Mir-137-P3-v1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Ami-Mir-137-P3-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0038154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAG -59
Get sequence
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