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116 microRNA genes of family MIR-103
Sort by genome coordinates
Motifs
MirGeneDB ID
MiRBase ID
Family
Seed
5p accession
3p accession
Chromosome
Start
End
Strand
Node of origin (locus)
Node of origin (family)
3' NTU
UG
UGUG
▼
CNNC
Spu-Mir-103
spu-mir-2013
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0009742
AAGJ06000002.1
1770908
1770972
-
Deuterostomia
Deuterostomia
No
1
1
1
Pma-Mir-103-o1
pma-mir-103a
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0019441
NC_046077.1
13031137
13031200
+
P. marinus
Deuterostomia
No
1
1
Sko-Mir-103
sko-mir-2013
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0009737
NW_003120936.1
115062
115119
-
Deuterostomia
Deuterostomia
No
1
1
Pfl-Mir-103
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
LD346721.1
581831
581890
-
Deuterostomia
Deuterostomia
Yes
Pmi-Mir-103
pmi-mir-2013
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0032188
JH783623.1
1378
1440
+
Deuterostomia
Deuterostomia
No
1
Xbo-Mir-103
xbo-mir-2013
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0020119
3C-assembly_contig_1892
2634204
2634263
+
Deuterostomia
Deuterostomia
No
1
1
Tgu-Mir-103-P1
tgu-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0014556
6
18453193
18453252
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Sto-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
BFAA01004041.1
116246
116305
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Hsa-Mir-103-P1
hsa-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0000104
chr10
89592756
89592815
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ami-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
NW_017708881.1
6617839
6617898
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cmi-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
KI635857.1
4271538
4271597
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mml-Mir-103-P1
mml-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0026584
MIMAT0002458
chr9
84746628
84746687
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cpi-Mir-103-P1
cpi-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0037723
JH584602
3599120
3599179
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mmu-Mir-103-P1
mmu-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0017048
MIMAT0000647
chr19
34820700
34820759
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Aca-Mir-103-P1
aca-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0021713
MIMAT0021714
GL343219.1
2879
2938
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Rno-Mir-103-P1
rno-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0017115
MIMAT0000826
chr1
253128263
253128322
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Pbv-Mir-103-P1
pbv-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0038907
MIMAT0038908
KE955805.1
52260
52318
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cpo-Mir-103-P1
cpo-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0046959
MIMAT0046960
scaffold_15
2118337
2118396
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Gja-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
NW_015177082.1
59994
60053
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ocu-Mir-103-P1
ocu-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0048199
MIMAT0048200
chr18
37563532
37563591
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Spt-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
QEPC01014088.1
1059792
1059851
-
Gnathostomata
Deuterostomia
Unknown
1
Cfa-Mir-103-P1
cfa-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0006666
chr28
4484651
4484710
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Bta-Mir-103-P1
bta-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003785
NC_037353.1
11256218
11256277
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Xtr-Mir-103-P1
xtr-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003584
chr7
28096649
28096708
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Dno-Mir-103-P1
dno-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0047608
MIMAT0047609
JH568486
886362
886421
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mun-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
103-P1_LR594639.1:131108830-131109089
101
160
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ete-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
JH980301
38416546
38416605
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Lch-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
JH128928.1
263589
263648
-
Gnathostomata
Deuterostomia
Unknown
1
Sha-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
GL834454.1
1480515
1480574
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mdo-Mir-103-P1
mdo-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0004100
1
81981121
81981180
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Oan-Mir-103-P1
oan-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0007118
MIMAT0007119
NC_041730.1
111210031
111210090
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Gga-Mir-103-P1
gga-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0026520
MIMAT0001147
6
20232380
20232439
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cli-Mir-103-P1
cli-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0038489
MIMAT0038490
scaffold112
365368
365427
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Loc-Mir-103-P1
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
JH591449.1
41699
41758
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
Xla-Mir-103-P1d
xla-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0046420
MIMAT0046421
NC_030737.1
24751990
24752049
+
X. laevis
Deuterostomia
No
1
Pma-Mir-103-o2
pma-mir-103b
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0019442
MIMAT0019443
NC_046097.1
13332364
13332421
+
P. marinus
Deuterostomia
No
1
Tgu-Mir-103-P2
tgu-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0026985
MIMAT0014523
4
3448340
3448399
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Sto-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
BFAA01003951.1
146390
146449
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
1
Hsa-Mir-103-P2
hsa-mir-103a-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0009196
MIMAT0000101
chr20
3917504
3917563
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ami-Mir-103-P2
ami-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0038121
MIMAT0038122
NW_017712067.1
5130272
5130331
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cmi-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
KI635913.1
2726514
2726573
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
1
Mml-Mir-103-P2
mml-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0002447
chr10
36786830
36786889
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cpi-Mir-103-P2
cpi-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0037720
MIMAT0037719
JH584586
8263438
8263497
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mmu-Mir-103-P2
mmu-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0017025
MIMAT0000546
chr2
131288066
131288125
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Aca-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
G889P66450RD9
417
476
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Rno-Mir-103-P2
rno-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0017113
MIMAT0000824
chr3
123833685
123833744
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Pbv-Mir-103-P2
pbv-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0038904
KE957747.1
64005
64064
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cpo-Mir-103-P2
cpo-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0046952
MIMAT0046951
scaffold_8
20792589
20792648
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Gja-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
NW_015171560.1
17332
17391
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ocu-Mir-103-P2
ocu-mir-103a-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0048191
MIMAT0048190
chr4
10776359
10776418
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
Spt-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
QEPC01003849.1
4695356
4695415
-
Gnathostomata
Deuterostomia
Unknown
1
Cfa-Mir-103-P2
cfa-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0006687
chr24
17468361
17468420
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Bta-Mir-103-P2
bta-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003521
NC_037340.1
51282169
51282228
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Xtr-Mir-103-P2
xtr-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003663
chr1
6083405
6083464
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
1
Dno-Mir-103-P2
dno-mir-103a-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0047603
MIMAT0047602
JH569064
129126
129185
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
1
Mun-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
103-P2_LR594633.1:467087255-467087514
101
160
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ete-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
JH980296
19486868
19486927
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Lch-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
BAHO01049067.1
369
428
-
Gnathostomata
Deuterostomia
Unknown
1
Sha-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
GL834788.1
1243604
1243663
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mdo-Mir-103-P2
mdo-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0031097
MIMAT0004099
1
727148324
727148383
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Oan-Mir-103-P2
oan-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0006941
MIMAT0006942
NC_041745.1
18562503
18562562
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Gga-Mir-103-P2
gga-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0026519
MIMAT0001145
4
88526022
88526081
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cli-Mir-103-P2
cli-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0038486
MIMAT0038485
scaffold203
1112346
1112405
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Loc-Mir-103-P2
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
LG4
4457264
4457323
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
1
Xla-Mir-103-P2d
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
NC_030725.1
6585289
6585348
+
X. laevis
Deuterostomia
No
1
1
Tgu-Mir-103-P4
tgu-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0014523
13
5236672
5236731
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Sto-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
BFAA01001934.1
384944
385003
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Hsa-Mir-103-P4
hsa-mir-103a-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0037306
MIMAT0000101
chr5
168560904
168560963
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ami-Mir-103-P4
ami-mir-103
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0038119
NW_017709751.1
9717031
9717090
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cmi-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
KI635998.1
913584
913643
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mml-Mir-103-P4
mml-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0026582
MIMAT0002447
chr6
166809206
166809265
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cpi-Mir-103-P4
cpi-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0037719
JH584664
1918309
1918368
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mmu-Mir-103-P4
mmu-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0017024
MIMAT0000546
chr11
35782410
35782469
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Aca-Mir-103-P4
aca-mir-103
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0021715
MIMAT0021716
2
189292162
189292221
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Rno-Mir-103-P4
rno-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0017114
MIMAT0000824
chr10
20606729
20606788
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Pbv-Mir-103-P4
pbv-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0038904
KE956450.1
111712
111771
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cpo-Mir-103-P4
cpo-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0046950
MIMAT0046951
scaffold_17
14743814
14743873
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Gja-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
NW_015163608.1
1590539
1590598
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
Ocu-Mir-103-P4
ocu-mir-103a-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0048189
MIMAT0048190
chr3
49920405
49920464
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Spt-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
QEPC01008745.1
4861748
4861807
+
Gnathostomata
Deuterostomia
Unknown
1
Cfa-Mir-103-P4
cfa-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0006687
chr4
43182878
43182937
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Xla-Mir-103-P4
xla-mir-103a
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0046414
MIMAT0046415
NC_030729.1
111898598
111898657
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Bta-Mir-103-P4
bta-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003521
NC_037347.1
312543
312602
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Xtr-Mir-103-P4
xtr-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003663
chr3
24141506
24141565
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Dno-Mir-103-P4
dno-mir-103a-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0047601
MIMAT0047602
JH561766
252156
252215
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mun-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
103-P3_LR594636.1:83663042-83663301
101
160
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Ete-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
JH980294
62610581
62610640
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Lch-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
JH126669.1
1588486
1588546
-
Gnathostomata
Deuterostomia
Unknown
1
1
Sha-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
GL834618.1
2051965
2052024
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Mdo-Mir-103-P4
mdo-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0026658
MIMAT0004099
1
367063033
367063092
-
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Oan-Mir-103-P4
oan-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0031098
MIMAT0006942
NC_041749.1
21728165
21728224
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
1
Gga-Mir-103-P4
gga-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0031070
MIMAT0001145
13
5440016
5440075
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Cli-Mir-103-P4
cli-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0038485
scaffold79
13537713
13537772
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Loc-Mir-103-P4
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
LG6
35850085
35850144
+
Gnathostomata
Deuterostomia
No
1
Bfl-Mir-103-P5
bfl-mir-2013
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0009991
NC_049987.1
7512038
7512104
-
Branchiostoma
Deuterostomia
No
1
1
Bla-Mir-103-P5
None
MIR-103
GCCAUUG
None
None
Sc0000420
183063
183129
-
Branchiostoma
Deuterostomia
No
1
1
Bfl-Mir-103-P6
bfl-mir-2064
MIR-103
AGCAGCA
None
MIMAT0009990
NC_049987.1
7507428
7507486
-
Branchiostoma
Deuterostomia
No
1
Bla-Mir-103-P6
None
MIR-103
AGCAGCA
None
None
Sc0000420
179103
179161
-
Branchiostoma
Deuterostomia
No
1
Bfl-Mir-103-P7
bfl-mir-2066
MIR-103
AGCAGCA
None
MIMAT0009994
NC_049980.1
23514642
23514701
+
Branchiostoma
Deuterostomia
No
1
1
Bla-Mir-103-P7
None
MIR-103
AGCAGCA
None
None
Sc0000082
845654
845713
-
Branchiostoma
Deuterostomia
No
1
1
Bfl-Mir-103-P8
bfl-mir-2067
MIR-103
AGCAGCA
None
MIMAT0009995
NC_049980.1
23517098
23517157
+
Branchiostoma
Deuterostomia
Yes
Bla-Mir-103-P8
None
MIR-103
AGCAGCA
None
None
Sc0000082
843372
843431
-
Branchiostoma
Deuterostomia
Yes
Tni-Mir-103-P1a
tni-mir-107
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003044
17
10614424
10614483
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
Mal-Mir-103-P1a
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
KV884740.1
2105509
2105568
-
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
Dre-Mir-103-P1a
dre-mir-107b
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0011301
chr17
23573143
23573202
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
Tni-Mir-103-P2a
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
10
12326434
12326493
-
Clupeocephala
Deuterostomia
No
Gmo-Mir-103-P2a
gmo-mir-103-1
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0044189
MIMAT0044050
GeneScaffold_2355
136951
137010
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
Mal-Mir-103-P2a
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
KV884752.1
495213
495272
-
Clupeocephala
Deuterostomia
No
Dre-Mir-103-P2a
dre-mir-103
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0001816
chr13
15223311
15223370
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
1
Dre-Mir-103-P1b
dre-mir-107a
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0031959
MIMAT0001817
chr12
16960706
16960765
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
Tni-Mir-103-P2b
tni-mir-103
MIR-103
GCAGCAU
None
MIMAT0003042
1
5372738
5372798
-
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
1
Gmo-Mir-103-P2b
gmo-mir-103-2
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0044049
MIMAT0044050
contig394168
1003
1060
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
1
Mal-Mir-103-P2b
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
KV884932.1
147066
147125
-
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
1
Dre-Mir-103-P2b
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
chr14
44827467
44827526
+
Clupeocephala
Deuterostomia
No
1
Xla-Mir-103-P1c
None
MIR-103
GCAGCAU
None
None
NC_030736.1
31181719
31181778
-
X. laevis
Deuterostomia
No
1
Xla-Mir-103-P2c
xla-mir-103b
MIR-103
GCAGCAU
MIMAT0046416
MIMAT0046417
NC_030724.1
3027962
3028021
-
X. laevis
Deuterostomia
No
1
1
Download sequences for:
precursor
|
5p
|
3p
|
mature
|
star
|
mature/star
|
loop
|
extend_pre
|
all